Bir gaz kromatografının temel yapısı, bir analiz ünitesi ve bir görüntüleme ünitesi olmak üzere iki bölümden oluşur. İlki esas olarak gaz kaynağı ve kontrol ölçüm cihazı, örnekleme cihazı, termostat ve kromatografik kolon içerir. İkincisi esas olarak doğrulayıcıları ve otomatik kayıt cihazlarını içerir. Kromatografik kolon (sabit faz dahil) ve kalibratör, bir gaz kromatografının temel bileşenleridir.
(1) Taşıyıcı gaz sistemi Gaz kromatografındaki gaz devresi, taşıyıcı gazın sürekli çalıştığı kapalı boru hattı sistemidir. Tüm taşıyıcı gaz sistemi, saf taşıyıcı gaz, iyi hava geçirmezlik, istikrarlı akış hızı ve doğru akış hızı ölçümü gerektirir.
(2) Örnekleme sistemi Örnekleme, kromatografik kolonun üst ucuna hızlı ve kantitatif olarak bir gaz veya sıvı numune eklenmesidir.
(3) Ayırma sistemi Ayırma sisteminin çekirdeği, çok bileşenli numuneleri ayrı bileşenlere ayırmak için kullanılan kromatografik sütundur. İki tip kromatografik sütun vardır: paketlenmiş sütunlar ve kılcal sütunlar.
(4) Algılama sistemi dedektörünün işlevi, kromatografik kolon tarafından ayrılan numune bileşenlerini, özelliklerine ve içeriklerine göre elektrik sinyallerine dönüştürmektir ve amplifikasyondan sonra, kaydedici bunları bir kromatograma kaydeder.
(5) Sinyal kayıt veya bilgisayar veri işleme sistemi Son yıllarda, gaz kromatografları esas olarak kromatografik veri işlemcileri kullanmaktadır. Kromatografik veri işlemcisi, kromatogramı yazdırabilir ve kaydedebilir ve tutma süresi, ölçülen bileşenlerin kütle fraksiyonu vb. gibi işlenmiş sonuçları aynı kayıt kağıdına yazdırabilir.
(6) Sıcaklık kontrol sistemi Kromatografik kolon, dedektör ve gazlaştırma odasının sıcaklığını kontrol etmek ve ölçmek için kullanılır ve gaz kromatografının önemli bir parçasıdır. Gaz kromatografları iki kategoriye ayrılır: biri gaz-katı kromatograf, diğeri gaz-sıvı dağılım kromatografıdır. Bu iki tip kromatograf tarafından ayrılan sabit fazlar farklıdır, ancak aletlerin yapısı ortaktır.